Если предприниматель работает по франчайзингу и он, согласно договору франчайзинга, обязан выплачивать определенный процент с оборота своего предприятия франчайзеру, то эта сумма выплаты облагается налогом на прибыль со стороны государства?

Смотря в каком государстве заключён договор. Территория постсоветского пространства большая и в каждом государстве свои законы на уплату от прибыли. Например, в той же Украине сейчас налоги на всё.

с 1 января 2006 года с сумм выплачиваемых роялти российская компания – источник выплаты признается налоговым агентом и должна уплачивать НДС. В соответствии с п.4 ст. 148 НК, местом реализации работ (услуг) признается Российская Федерация, если покупатель работ (услуг) осуществляет здесь деятельность. Данное положение применяется и при «передаче, предоставлению патентов, лицензий, торговых марок, авторских прав или иных аналогичных прав». До 2006 года этот пункт ст. 148 НК звучал так: «передача в собственность или переуступка патентов, лицензий…», т.е. НДС облагалась только передача исключительных прав (прав собственности) на эти нематериальные активы.

Любая прибыль будет облагаться государством, вопрос только куда Вы эту прибыль будете девать? Или себе в карман или на выплату процентов, ведь выплачивая деньги франчайзеру Вы автоматически приобретаете часть своих прав на данный бизнес и становитесь всё более и более полноправным владельцем данного заведения.

Что значит становитесь все более полноправным владельцем? Покупая франшизу, вы не становитесь владельцем торговой марки, а только являетесь владельцем франшизы, и не более того. Но вот все имущество, при помощи которого вы осуществляете свою деятельность, оно и так ваше.

Вовсе не обязательно придерживаться авторских прав на какой-либо раскрученный бренд, бизнес можно и копировать, но, будет ли он пользоваться спросом? Зато не нужно будет никому платить авторский гонорар.